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Python

使用python实现BLAST

最近在自学python,又用python实现了一下BLAST。这次更新了打分函数如下,空位罚分改为-5,但不区分gapopen和gapextend。'''''@author:JiuYu'''defscore(a,b):#scoringfunctionscore=0lst=['AC','GT','CA','TG']ifa==b:score+=2elifa+binlst:score+=-5else:score+=-7returnscoredefBLAST(se

系统 2019-09-27 17:52:10 1989

Python

Python 中的上下文管理器

Python中的上下文管理器withexpression[astarget]:with-body上下文管理器是为with语句而生。只要实现了上下文管理器协议__enter__与__exit__,就可以使用with语句。__enter__通常执行一些初始化操作,并且该函数的返回值会赋值给可选的astarget中的target变量。__exit__执行资源清理工作。它接收三个参数,异常类型,异常实例,和异常栈,根据这些异常信息,__exit__可以选择进行相应

系统 2019-09-27 17:51:21 1989

Python

Python中使用第三方库xlrd来读取Excel示例

本篇文章介绍如何使用xlrd来读取Excel表格中的内容,xlrd是第三方库,所以在使用前我们需要安装xlrd。另外我们一般会使用xlwt来写Excel,所以下一篇文章我们会来介绍如何使用xlwt来写Excel。xlrd下载:xlrd0.8.0安装xlrd安装xlrd,只需运行setup即可,另外你也可以直接解压缩到你的project中,也可以直接用xlrd的API获取Excel,这里称之为workbook复制代码代码如下:open_workbook(fi

系统 2019-09-27 17:51:03 1989

Python

python基础面试题整理---从零开始 每天十题(03)

一、Q:用Python输出一个Fibonacci数列?(斐波那契额数列)A:我们先来看下代码#!/usr/bin/envpython#-*-coding:utf-8-*-deffib_recur(n):ifn<=1:returnnreturnfib_recur(n-1)+fib_recur(n-2)foriinrange(1,20):print(fib_recur(i),end="")我们来详细的看一下代码,我们知道斐波那契数据为1,1,2,3,5,8,1

系统 2019-09-27 17:49:20 1989

Python

python 调用百度地图地点检索webAPI

百度地图提供了开放的API,使用方法WEB服务API右上角登陆账号->点击“获取密钥”->“创建应用”->填写应用名称&白名单IP->然后复制AK(例如u2uqy7Gxui0XyBdcHLU0D3hQINLKokc0)然后直接上代码API提供了3种方式1行政区划区域检索2圆形区域检索3矩形区域检索详情可见API详情本文以1,3为例importrequestsurl="http://api.map.baidu.com/place/v2/search"quer

系统 2019-09-27 17:49:03 1989

Python

Python 正则表达式爬虫使用案例解析

现在拥有了正则表达式这把神兵利器,我们就可以进行对爬取到的全部网页源代码进行筛选了。下面我们一起尝试一下爬取内涵段子网站:http://www.neihan8.com/article/list_5_1.html打开之后,不难看出里面一个一个非常有内涵的段子,当你进行翻页的时候,注意url地址的变化:第一页url:http://www.neihan8.com/article/list_5_1.html第二页url:http://www.neihan8.com

系统 2019-09-27 17:48:39 1989

Python

Python psutil模块简单使用实例

安装很简单复制代码代码如下:pipinstallpsutil官网地址为:https://pythonhosted.org/psutil/(文档上有详细的api)github地址为:https://github.com/giampaolo/psutil/psutil比较好的地方,一个是跨平台,不需要切换平台的时候在重新开放了,另外一个好处的工具集中CPU,memory,disks,network,这些信息都可以获得到。可以用来做系统监控,性能分析,进程管理。

系统 2019-09-27 17:48:35 1989

Python

python字典和结构化数据

5.1字典数据类型字典的索引可以使用许多不同类型的数据,不只是整数。字典的索引被称为“键”,键及其关联的值称为“键—值”对,在代码中,字典输入时带花括号{}。字典中的表项是不排序的,所以字典不能像列表那样切片。5.1.1keys()、values()和items()方法key()、values()和items()方法将返回类似于列表的值,分别对应于字典的键、值和键-值对。这些方法返回的值不是真正的列表,他们不能被修改,没有append()方法。但这些数据类

系统 2019-09-27 17:48:20 1989

Python

使用SAE部署Python运行环境的教程

因为GAE在国内访问不便,所以平时有一些小应用,我都会放在SAE上面,虽然SAE还有很多缺陷,但算是上手比较容易的一个了,最起码文档写的不错。开发SAE上的应用,我一般都用Flask,SAE预装了Flask,所以你可以直接用,但我们难免会用一些没有预装的库。如果是在以前,可能需要自己将package挨个copy到应用目录中,然后手动加载,现在嘛,不需要那么麻烦了,SAE有个非常不错的解决方案,见《安装依赖的第三方包》你可以使用saecloud来代替pip安

系统 2019-09-27 17:48:13 1989

Python

Python全局未知异常捕获

log日志监测程序运行:可以1⃣️Linux重定向将python运行报错记录到log日志中,2⃣️或者用python内置的logging模块。但是在用logging模块时,try...except...可以捕获到可预见/考虑到的异常,用logging记录到log日志文件中,但是在对于未知异常或导致程序退出时的情形无法记录到log日志中,用Linux的重定向可以捕捉到。现在到问题时我不想用Linux系统提供的重定向方法,我需要捕获python运行中未知的异常

系统 2019-09-27 17:48:09 1989