Hadoop 的 TotalOrderPartitioner

系统 2241 0
http://blog.oddfoo.net/2011/04/17/mapreduce-partition%E5%88%86%E6%9E%90-2/

Partition所处的位置


Partition位置

Partition主要作用就是将map的结果发送到相应的reduce。这就对partition有两个要求:

1)均衡负载,尽量的将工作均匀的分配给不同的reduce。

2)效率,分配速度一定要快。

Mapreduce提供的Partitioner


Mapreduce默认的partitioner是HashPartitioner。除了这个mapreduce还提供了3种partitioner。如下图所示:

patition类结构


1. Partitioner 是partitioner的基类,如果需要定制partitioner也需要继承该类。

2. HashPartitioner是mapreduce的默认partitioner。计算方法是

which reducer=(key.hashCode() & Integer.MAX_VALUE) % numReduceTasks,得到当前的目的reducer。

3. BinaryPatitioner继承于Partitioner< BinaryComparable ,V>,是Partitioner的偏特化子类。该类提供leftOffset和rightOffset,在计算which reducer时仅对键值K的[rightOffset,leftOffset]这个区间取hash。

Which reducer=(hash & Integer.MAX_VALUE) % numReduceTasks

4. KeyFieldBasedPartitioner也是基于hash的个partitioner。和BinaryPatitioner不同,它提供了多个区间用于计算hash。当区间数为0时KeyFieldBasedPartitioner退化成HashPartitioner。

5. TotalOrderPartitioner这个类可以实现输出的全排序。不同于以上3个partitioner,这个类并不是基于hash的。在下一节里详细的介绍totalorderpartitioner。

TotalOrderPartitioner


每一个reducer的输出在默认的情况下都是有顺序的,但是reducer之间在输入是无序的情况下也是无序的。如果要实现输出是全排序的那就会用到TotalOrderPartitioner。

要使用TotalOrderPartitioner,得给TotalOrderPartitioner提供一个partition file。这个文件要求Key (这些key就是所谓的划分)的数量和当前reducer的数量-1相同并且是从小到大排列。对于为什么要用到这样一个文件,以及这个文件的具体细节待会还会提到。

TotalOrderPartitioner对不同Key的数据类型提供了两种方案:

1) 对于非BinaryComparable(参考附录A)类型的Key,TotalOrderPartitioner采用二分发查找当前的K所在的index。

例如reducer的数量为5,partition file 提供的4个划分为【2,4,6,8】。如果当前的一个key value pair 是<4,”good”>利用二分法查找到index=1,index+1=2那么这个key value pair将会发送到第二个reducer。如果一个key value pair为<4.5, “good”>那么二分法查找将返回-3,同样对-3加1然后取反就是这个key value pair 将要去的reducer。

对于一些数值型的数据来说,利用二分法查找复杂度是o(log (reducer count)),速度比较快。

2) 对于BinaryComparable类型的Key(也可以直接理解为字符串)。字符串按照字典顺序也是可以进行排序的。这样的话也可以给定一些划分,让不同的字符串key分配到不同的reducer里。这里的处理和数值类型的比较相近。

例如reducer的数量为5,partition file 提供了4个划分为【“abc”, “bce”, “eaa”, ”fhc”】那么“ab”这个字符串将会被分配到第一个reducer里,因为它小于第一个划分“abc”。

但是不同于数值型的数据,字符串的查找和比较不能按照数值型数据的比较方法。mapreducer采用的Tire tree的字符串查找方法。查找的时间复杂度o(m),m为树的深度,空间复杂度o(255^m-1)。是一个典型的空间换时间的案例。

Tire Tree


Tire tree的构建

假设树的最大深度为3,划分为【aaad ,aaaf, aaaeh,abbx 】

tairtree结构


Mapreduce里的Tire tree主要有两种节点组成:
1) Innertirenode
Innertirenode在mapreduce中是包含了255个字符的一个比较长的串。上图中的例子只包含了26个英文字母。
2) 叶子节点{unslipttirenode, singesplittirenode, leaftirenode}
Unslipttirenode 是不包含划分的叶子节点。
Singlesplittirenode 是只包含了一个划分点的叶子节点。
Leafnode是包含了多个划分点的叶子节点。(这种情况比较少见,达到树的最大深度才出现这种情况。在实际操作过程中比较少见)

Tire tree的搜索过程

接上面的例子:
1)假如当前 key value pair这时会找到图中的leafnode,在leafnode内部使用二分法继续查找找到返回 aad在 划分数组中的索引。找不到会返回一个和它最接近的划分的索引。
2)假如找到singlenode,如果和singlenode的划分相同或小返回他的索引,比singlenode的划分大则返回索引+1。
3)假如找到nosplitnode则返回前面的索引。如将会返回abbx的在划分数组中的索引。

TotalOrderPartitioner的疑问

上面介绍了partitioner有两个要求,一个是速度另外一个是均衡负载。使用tire tree提高了搜素的速度,但是我们怎么才能找到这样的partition file 呢?让所有的划分刚好就能实现均衡负载。

InputSampler
输入采样类,可以对输入目录下的数据进行采样。提供了3种采样方法。

采样类结构图

采样方式对比表:

类名称

采样方式

构造方法

效率

特点

SplitSampler<K,V>

对前n个记录进行采样

采样总数,划分数

最高

RandomSampler<K,V>

遍历所有数据,随机采样

采样频率,采样总数,划分数

最低

IntervalSampler<K,V>

固定间隔采样

采样频率,划分数

对有序的数据十分适用

writePartitionFile这个方法很关键,这个方法就是根据采样类提供的样本,首先进行排序,然后选定(随机的方法)和reducer数目-1的样本写入到partition file。这样经过采样的数据生成的划分,在每个划分区间里的key value pair 就近似相同了,这样就能完成均衡负载的作用。

TotalOrderPartitioner实例


    
public class SortByTemperatureUsingTotalOrderPartitioner extends Configured implements Tool { @Override public int run(String[]args) throws Exception { JobConfconf=JobBuilder.parseInputAndOutput( this ,getConf(),args); if (conf== null ){ return -1; } conf.setInputFormat(SequenceFileInputFormat. class ); conf.setOutputKeyClass(IntWritable. class ); conf.setOutputFormat(SequenceFileOutputFormat. class ); SequenceFileOutputFormat.setCompressOutput(conf, true ); SequenceFileOutputFormat .setOutputCompressorClass(conf,GzipCodec. class ); SequenceFileOutputFormat.setOutputCompressionType(conf, CompressionType.BLOCK); conf.setPartitionerClass(TotalOrderPartitioner. class ); InputSampler.Sampler<IntWritable,Text>sampler= new InputSampler.RandomSampler<IntWritable,Text>( 0.1,10000,10); Pathinput=FileInputFormat.getInputPaths(conf)[0]; input=input.makeQualified(input.getFileSystem(conf)); PathpartitionFile= new Path(input,"_partitions"); TotalOrderPartitioner.setPartitionFile(conf,partitionFile); InputSampler.writePartitionFile(conf,sampler); // AddtoDistributedCache URIpartitionUri= new URI(partitionFile.toString()+"#_partitions"); DistributedCache.addCacheFile(partitionUri,conf); DistributedCache.createSymlink(conf); JobClient.runJob(conf); return 0; } public static void main(String[]args) throws Exception{ int exitCode=ToolRunner.run( new SortByTemperatureUsingTotalOrderPartitioner(),args); System.exit(exitCode); } }

示例程序引用于:http://www.cnblogs.com/funnydavid/archive/2010/11/24/1886974.html

附录A
Text 为BinaryComparable,WriteableComparable类型。
BooleanWritable、ByteWritable、DoubleWritable、MD5hash、IntWritable、FloatWritable、LongWritable、NullWriable等都为WriteableComparable。

http://www.cnblogs.com/OnlyXP/archive/2008/12/06/1349026.html

在0.19.0以前的版本中,Hadoop自身并没有提供全排序的solution,如果使用缺省的partitioner(HashPartitioner)每个reducer的输出自身是有序的,但是多个reducer的输出文件之间不存在全序的关系;如果想实现全排序,需要自己实现Partitioner,比如针对key为Mac地址的Partitioner,如假定Mac地址的分布是均匀的,可以根据Mac地址的前两个字节构造不超过255个reducer的Partitioner;但是这种Partitoiner是应用逻辑相关的,因此没有通用性,为此Hadoop 0.19.0提供了一个通用的全序Partitioner。

TotalOrderPartitioner最初用于 Hadoop Terasort ,也许是考虑到其通用性,后来作为0.19.0的release feature发布。

Partitioner的目的是决定每一个Map输出的Record由哪个Reducer来处理,它必须尽可能满足
1. 平均分布。即每个Reducer处理的Record数量应该尽可能相等。

2. 高效。由于每个Record在Map Reduce过程中都需要由Partitioner分配,它的效率至关重要,需要使用高效的算法实现。
获取数据的分布

对于第一点,由于TotalOrderPartitioner 事先并不知道key的分布,因此需要通过少量数据sample估算key的分布,然后根据分布构造针对的Partition模型。

0.19.0中有一个InputSampler就是做这个事情的,
通过指定Reducer个数, 并读取一部分的输入数据作为sample,将sample数据排序并根据Reducer个数等分后,得到每个Reducer处理的区间。比如包含9条数据的sample,其排好序的key分别为:
a b c d e f g h i
如果指定Reducer个数为3,每个Reducer对应的区间为

Reducer0 [a, b, c]
Reducer1 [d, e, f]
Reducer2 [g, h, i]

区间之间的边界称为Cut Point ,上面三个Reducer的Cut point为 d, g InputSampler将这cut points排序并写入HDFS文件,这个文件即包含了输入数据的分布规律。

根据分布构建高效Partition模型

对于上面提到的第2点,高效性,
在读取数据的分布规律文件之后,TotalOrderPartitioner会判断key是不是BinaryComparable类型的。

BinaryComparable的含义是“字节可比的”,o.a.h.io.Text就是一个这样的类型,因为两个Text对象可以按字节比较,如果对应的字节不相等就立刻可以判断两个Text的大小。

先说不是
BinaryComparable 类型的情况,这时 TotalOrderPartitioner会使用二分查找BinarySearch来确定key属于哪个区间,进而确定属于哪个Reducer,每一次查找的时间复杂度为O(logR),R为Reducer的个数。

如果key是
BinaryComparable类型, TotalOrderPartitioner会根据 cut points构造 Trie Trie 是一种更为高效的用于查找的数据结构, 这种数据结构适合key为字符串类型,如下图

TotalOrderPartitioner中的Trie缺省 深度为2,即使用2+1个prefix构造Trie;每个父节点有255个子节点,对应255个ASCII字符。查找的时间复杂度为O(m),m为树的深度,空间复杂度为O(255 m-1 ),可以看到,这是一种空间换时间的方案,当树深度为2时,可以最多分配255 * 255个reducer,这在绝大情况下足够了。

可以看到,使用
Trie进行Partition的效率高于binarySearch,单次执行两种查找可能不会有 什么感觉,但是当处理亿计的Record时,他们的差距就明显了。

Hadoop 的 TotalOrderPartitioner


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