之前用featureCount 处理得到结果,要提出第一列gene_id 和 readcount 列,首先软件输出的第一行默认是你使用的命令行,没有用,用bash批量删掉。
删除当前文件夹下所有文件第一行。
其实提出两列很简单,不过我受够了每次一个文件执行一次的烦。想搞成别的程序调用时命令行参数直接就行。第一次知道sys.argv这玩意,学到了。
我设置了 -i 输入,-o 输出 这两个参数来判断输入输出文件个数,不过对于错误命令行输入的判断还很欠缺,毕竟只有自己用。
上代码:
其实python里面 str 和list 弄的还是昏头昏脑的,每次都要错了再改。
以上就是本文的全部内容,希望对大家的学习有所帮助,也希望大家多多支持脚本之家。