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Python

使用python实现BLAST

最近在自学python,又用python实现了一下BLAST。这次更新了打分函数如下,空位罚分改为-5,但不区分gapopen和gapextend。'''''@author:JiuYu'''defscore(a,b):#scoringfunctionscore=0lst=['AC','GT','CA','TG']ifa==b:score+=2elifa+binlst:score+=-5else:score+=-7returnscoredefBLAST(se

系统 2019-09-27 17:52:10 1886

Python

python学习笔记——小插曲

作为eclipse的忠实粉丝,我自然乐意用eclipse来编写。于是捣鼓了一小会儿就搞好了。但是我运行的第一个程序出现了一个很奇怪的问题:SyntaxError:(unicodeerror)‘utf-8’codeccan’tdecodebyte0xceinposition16:invalidcontinuationbyte我隐约的看到了utf-8,知道了肯定是编码的问题,可是我寻思我没有写汉字呀原来是自动生成的日期中有中文。删掉就好了。但是如果我们真的需要

系统 2019-09-27 17:52:01 1886

Python

python学习笔记——循环

for我们先来看一下for语句的格式:foriinrange(0,5):print(i)其中range相当于一个迭代器。我们可以这么尝试:print(list(range(0,5)))输出很简单了,就是01234当然了这里的迭代器可以用自己的list比如:cgg=["cgg","cgg1","cgg2"]foriincgg:print(i)输出结果就是三个字符串以此输出。while循环语句当然少不了while了先来看看while的格式:whilecgg<1

系统 2019-09-27 17:51:52 1886

Python

解读Python中 locals() 和 globals() 内置函数

首先globals()和locals()是作用于作用域下的内置函数,所以我将它们分为作用域类型的内置函数1.作用域相关:1)globals()#返回全局作用域中的所有名字2)locals()#返回本地作用域中的所有名字可能对于这个作用域相关的内置函数,大家一接触都会很懵,这个东西是干什么的?它怎么用?今天小编就给大家来解释一下,首先我们来先看下官方的解释:globals()——获取全局变量的字典locals()——获取执行本方法所在命名空间内的局部变量的字

系统 2019-09-27 17:50:51 1886

Python

CentOS 7下安装Python3.6 及遇到的问题小结

先给大家介绍下CentOS7下安装Python3.6的方法安装python3.6可能使用的依赖yuminstallopenssl-develbzip2-develexpat-develgdbm-develreadline-develsqlite-devel•到python官网找到下载路径,用wget下载wgethttps://www.python.org/ftp/python/3.6.4/Python-3.6.4.tgz•解压tgz包tar-zxvfPyt

系统 2019-09-27 17:50:23 1886

Python

Python中实现单例模式的n种方式和原理

在Python中如何实现单例模式?这可以说是一个经典的Python面试题了。这回我们讲讲实现Python中实现单例模式的n种方式,和它的原理。什么是单例模式维基百科中说:单例模式,也叫单子模式,是一种常用的软件设计模式。在应用这个模式时,单例对象的类必须保证只有一个实例存在。许多时候整个系统只需要拥有一个的全局对象,这样有利于我们协调系统整体的行为。比如在某个服务器程序中,该服务器的配置信息存放在一个文件中,这些配置数据由一个单例对象统一读取,然后服务进程

系统 2019-09-27 17:50:21 1886

Python

python之模块和包

一Python模块简介1模块化一般来说,编程语言中,库,包,模块是同一种概念,是代码组织方式python中只有一种模块对象类型,但是为了模块化组织的便利,提供了一个概念:包模块(module):指的是python的源代码文件包(package):指的是模块组织在一起放入和包名同名的目录及相关文件可以将代码量较大的程序分割成多个有组织,彼此间独立但又能互相交互的代码片段,这些自我包含的有组织的代码段就是模块模块在物理形式上表现为以.py结尾的代码文件一个文件

系统 2019-09-27 17:49:43 1886

Python

Python下singleton模式的实现方法

很多开发人员在刚开始学Python时,都考虑过像c++那样来实现singleton模式,但后来会发现c++是c++,Python是Python,不能简单的进行模仿。Python中常见的方法是借助global变量,或者class变量来实现单件。本文就介绍以decorator来实现singleton模式的方法。示例代码如下:##-----------------------codebegin-----------------------#-*-coding:u

系统 2019-09-27 17:47:23 1886

Python

Python 正则表达式 re.match/re.search/re.sub

FromPython正则表达式re.match(pattern,string,flags=0)尝试从字符串起始位置匹配一个模式;如果不是起始位置匹配成功,则re.match()返回none.匹配成功,re.match()返回一个匹配的对象,否则返回None.pattern-匹配的正则表达式string-要匹配的字符串flags-标志位,控制正则表达式的匹配方式,如,是否区分大小写,多行匹配等.e.g.#!/usr/bin/python#-*-coding:

系统 2019-09-27 17:46:48 1886

Python

python画双y轴图像的示例代码

很多时候可能需要在一个图中画出多条函数图像,但是可能y轴的物理含义不一样,或是数值范围相差较大,此时就需要双y轴。matplotlib和seaborn都可以画双y轴图像。一个例子:importseabornassnsimportmatplotlib.pyplotasplt#ax1forKDE,ax2forCDFf,ax1=plt.subplots()ax1.grid(True)#ax1.set_ylim(0,1)ax1.set_ylabel('KDE')a

系统 2019-09-27 17:46:19 1886